La Maestría en Historia UNACH-UNICACH cuenta con reconocimiento internacional, sus profesores participan en cuerpos académicos consolidados y en líneas de generación y aplicación del conocimiento definidos, ofrece amplio abanico de oportunidades de desarrollo académico lo que hace que los alumnos se inserten de manera satisfactoria en el mercado laboral y coadyuvan en el desarrollo de la sociedad; ha creado vinculaciones con distintas organizaciones e instituciones públicas y privadas a partir de su creación y en el transcurso de su desarrollo académico se han hecho relaciones consolidadas con instancias académicas e instituciones que resguardan el patrimonio documental como las siguientes:
Programa de Maestría –Doctorado en Historia del Centro de Estudios Históricos del Colegio de Michoacán (COLMICH).
Rescate, ordenación y catalogación del archivo Diocesano de San Cristóbal de las Casas, Chiapas.
Red de colaboración académica entre profesores y estudiantes de la Maestría en Historia con investigadores del COLMICH.
Red de colaboración académica entre profesores y estudiantes de la Maestría en Historia con investigadores del CIESAS-Sureste.
Red de colaboración de cuerpos académicos sobre estudios de historia, antropología, arqueología y cosmovisión mayas.
Red de colaboración de cuerpos académicos sobre la temática: Tradición y modernidad en tres regiones de México apoyada por el PROMEP.
Red de colaboración de Facultades de Historia de Universidades de América Central organizadoras del congreso centroamericano de historia.
Red de colaboración de Cuerpos Académicos sobre la temática: Paisajes, historia y sociedades en Chiapas y Centroamérica.
Red de colaboración científica para el desarrollo y publicación de investigaciones históricas sobre el patrimonio cultural del estado de Chiapas.
Archivo histórico de la Casa de la Cultura jurídica ministra Gloria León Orantes.
Colaboración entre la UNICACH y la Asociación cultural Na Bolom Asociación Civil para realizar actividades académicas de la Maestría en Historia.
Convenio con la Asociación apoyo al desarrollo de archivos y bibliotecas a efecto de llevar a cabo el proyecto rescate de documentos históricos.
Convenio de intercambio académico entre el posgrado de Historia de la Facultad de Economía en la UNAM y la UNICACH.
Red de colaboración académica entre profesores y estudiantes de la Maestría en Historia con investigadores del CIMSUR-UNAM.
Desarrollo de actividades conjuntas de investigación, extensión y vinculación entre la UNICACH y el Centro INAH-Chiapas.
Convenio de colaboración entre la UNICACH y la UNAM, a fin de consolidar el espacio común de educación superior ECOES, que permita la movilidad de estudiantes y rofesores, a la armonización de los planes y programas de estudio y al fortalecimiento de áreas estratégicas para consolidar el núcleo promotor del ECOES.
Convenio de colaboración entre la UNICACH y CONECULTA, para el diseño y evaluación de proyectos de la dirección de patrimonio e investigación cultural, para la difusión de las investigaciones sobre historia local, regional y para la organización de conferencias, cursos y talleres bajo la asesoría y capacitación de docentes y estudiantes de la Maestría en Historia.
Red de colaboración académica entre profesores y estudiantes de la Maestría en Historia con investigadores del IIA-UNAM.
Red de colaboración académica entre profesores y estudiantes de la Maestría en Historia con investigadores del COLMEX.
Convenio de colaboración con el Archivo Histórico del Poder Judicial del estado de Chiapas.
Red de colaboración académica la Facultad de Humanidades de la UNICACH y la Universidad del país vasco de España.
Convenio de colaboración institucional entre la Universidad Autónoma de Chiapas y la Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Azcapotzalco.